Ayuste alternativo
Algunos genes son capaces de producir
distintos transcritos que proporcionarán distintas proteínas. Esto se debe a
que el transcrito primario tiene señales alternativas de ayuste que permiten a
la célula seleccionar entre dos sitios 3’ diferentes para eliminar distintos
intrones y exones. El patrón de ayuste de los intrones parece que se define
desde el mismo momento de la iniciación, ya que viene dictado por:
- las SR, así como otras proteínas, que se unen al
CTD durante la iniciación de la transcripción;
- unas secuencias en el mRNA que actúan como
potenciadores del salto de un intrón o del salto de un exón.
Se han identificado casos de ayuste
alternativo en:
- El antígeno T de SV40, la troponina T de ratón, o
el gen tra de Drosophila melanogaster en la que el ayuste
alternativo está regulado por el sexo.
- Los genes que sintetizan una proteína con
distinto extremo amino para que se dirijan al citoplasma o la mitocondria;
normalmente la forma mitocondrial o cloroplastídica es la más larga.
- El gen de la cadena pesada de la IgM (µ) produce una forma de membrana si aparecen todos los exones, mientras que la forma soluble carece de los exones 5 y 6 (los dos últimos) que le proporcionan el anclaje en la membrana.
Transayuste
A veces se ha observado que los exones de un mRNA maduro provienen de
diferentes RNA primarios. Así, el 10% de los genes sufre ayuste en trans o
transayuste en el nematodo Caenorhabditis elegans. También se ha detectado
en las proteínas ribosómicas codificadas en el cloroplasto y en todos los mRNA
del protozoo Trypanosoma brucei que tienen una secuencia común de 35 nt
en su extremo 5’.
El transayuste comienza por una reacción entre el sitio CURAY de un
transcrito y el sitio de ayuste 5’ de otro transcrito distinto. Luego, el sitio
5’ reacciona con el sitio 3’ de la misma molécula donde estaba el sitio de
ramificación, por lo que se eliminan dos intrones simultáneamente de dos genes
distintos, formando un intermediario en forma de Y.
Intrones que usan «madurasas»
Este tipo de intrones corresponden a los intrones del grupo I y del grupo
II que aparecen en algunos de genes mitocondriales en hongos como cob
(citocromo b) y cox1 (citocromo c oxidasa 1). En estos casos, el intrón
contiene un marco abierto de lectura en fase con el exón que le precede. Este
marco abierto codifica una madurasa que interviene de manera activa en el
ayuste. Aunque el marco de lectura puede contener los codones de inicio y
terminación, como es el caso del intrón que codifica la endonucleasa I-Dir1, lo
normal es que se traduzcan a partir del ATG del mRNA, por lo que la maduración
de estos intrones es obligadamente secuencial, puesto que hasta que no se
madura uno, el intrón siguiente no entra en fase y no fabrica su propia madurasa.
Por ejemplo, el intrón 4 del gen cob es un intrón del tipo I (bI4)
que codifica una madurasa para su propia escisión. Curiosamente esta madurasa
es necesaria para que también se procese el 4. º Intrón de cox1 (aI4). aI4
también tiene un marco abierto de lectura muy homólogo a la madurasa pero
codifica una endonucleasa «de
corte infrecuente» (rare cut) que reconoce una secuencia de 18 nt. Esta
secuencia sólo se obtiene cuando los exones 4 y 5 del gen cob o cox1
no están separados por el intrón, pues la secuencia diana de aI4 coincide con
la de la unión de los exones 4 y 5 (los que enmarcan a bI4 y aI4). De hecho,
esta endonucleasa sirve para propagar el intrón, por lo que presenta una
movilidad similar a la de los transposones. Algunos intrones del grupo II
contienen una ORF con actividad retrotranscriptasa
que también sirve para el salto del intrón a otra posición.
Bibliografia
ftp://ftp.utalca.cl/profesores/raherrera/.../av.../ayuste_otros.htm
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