lunes, 27 de febrero de 2012

unidad III







INSTITUTO TECNOLÓGICO DE CD. ALTAMIRANO GRO


LIC.: BIOLOGÍA


MATERIA: Biología molecular
Unidad III: “Organización del material genético”


NOMBRE DEL ALUMNO: Jovanny Uriel Arazte Chávez


Semestre y grupo:
VI semestre “a”


Profesor: Francisco Javier Puche Acosta



Cd. Altamirano, Gro a 27 de Febrero de 2012.



INTRODUCCION  
 


El material genético se compacta en un área discreta de la célula formando los cromosomas. Éstos se encuentran en los virus, células procariotas, en el núcleo de células eucariotas y en cloroplastos y mitocondrias.


 La organizacion del material genetico puede ser circular o lineal.








 EL CROMOSOMA EUCARIÓTICO.

Los cromosomas se encuentran en el núcleo celular separados del resto de la célula por la membrana nuclear. Un cromosoma tiene tres partes fundamentales: centrómero, telómero y los brazos.
El centrómero (constricción cromosómica primaria) es la estructura a la que se une el huso acromático. La región centromérica aparece normalmente como un y su posición define la relación entre las longitudes de los dos brazos centroméricos que es una característica muy útil. Según la posición del centrómero los cromosomas se clasifican en:
  • Telocéntricos con el centrómero en un extremo.
  • Acrocéntricos con el centrómero alejado del centro.
  • Metacéntricos con el cromosoma en el centro.
Los telómeros son secuencias situadas en los extremos de los cromosomas que les dan estabilidad. Se encuentran sobre todo en los cromosomas eucarióticos lineales.

El número de nucleolos difiere de un organismo a otro, variando entre uno y muchos. Los nucleolos contienen ARN ribosómico, un componente muy importante de los ribosomas. Los nucleolos se encuentran situados en las constricciones secundarias de los cromosomas llamadas organizadores nucleolares, que ocupan lugares específicos en el cromosoma.

En los centrómeros y telómeros se encuentra asociado ADN satélite que son segmentos de ADN altamente repetitivo y moderadamente repetitivo.

Los cromosomas eucarióticos están la mayor parte del ciclo celular como una sola cromátida y como dos cuando se replica. La replicación del ADN es semiconservativa, esto se demostró en un experimento en el que se marcó con tritio una cromátida. Entonces se procedió a replicar esta cromátida en presencia de tritio y se obtuvo un cromosoma de dos cromátidas marcadas. Se hizo volver a replicarse, esta vez sin presencia de tritio y se obtuvieron cuatro cromátidas formando dos cromosomas. Cada cromosoma tenía una molécula marcada y la otra no con lo que en la replicación se conservaba para el nuevo cromosoma una de las cromátidas parentales.





ORGANIZACIÓN DEL CROMOSOMA EUCARIÓTICO

En células eucarióticas que no se hayan sometidas a división celular el cromosoma re- cibe el nombre de cromatina. La cromatina consiste en fibras que contienen proteínas, ADN (en cantidades muy parecidas) y una pequeña porción de ARN. Las proteínas que se asocian al ADN son básicas y se llaman histonas. Las histonas que participan son H1, H2A, H2B, H3 y H4. Las histonas que participan son H1, H2A, H2B, H3 y H4 y su porcentaje de aminoácidos básicos y características son:


PRIMER NIVEL: NUCLEOSOMA
Esta estructura vista al microscopio se ve como si fuera un collar de perlas del que las cuentas son los nucleosomas.

El nucleosoma está formado por un octámero de histonas en el que hay dos subunidades de las histonas H2A, H2B, H3 y H4. Alrededor de este octámero se arrolla el ADN con dos vueltas. El espaciamento entre las cuentas está formado por ADN que se llama ADN puente. El nucleosoma mide 6 nm. Los nucleosomas se vuelven a organizar con la ayuda de la histona H1 habiendo una por cada nucleosoma.

SEGUNDO NIVEL: FIBRA DE 30 nm.
El nucleosoma que contiene H1 se pliega en una conformación en zigzag cuya aparien-cia sugiere que los nucleosomas interaccionan mediante contactos entre sus moléculas H1. Esta fibra que se forma tiene 30 nm de espesor, en el que se aprecian los nucleosomas. Las histonas H1 se disponen de manera que forman el eje central sobre el que se arrollan los nucleosomas. Por cada vuelta de la espiral que forma esta fibra hay seis nucleosomas. A este arrollamiento de los cromosomas sobre sí mismos se le llama solenoide.

TERCER NIVEL: FIBRA DE 200 nm.
Si eliminamos las histonas del cromosoma en metafase mitótica se puede ver que los cromosomas tienen un esqueleto central densamente teñido. Desde este esqueletose proyectan lazos de ADN que comienzan y acaban en el esqueleto. Este esqueleto central está compuesto por la enzima toposiomerasa II (enlazan o desenlazan nudos o lazos en una cadena) en el que parece haber regiones especiales llamadas regiones de unión al esqueleto o SAR.

CUARTO NIVEL: CROMOSOMA
Se produce por el arrollamiento de la fibra de 200 nm sobre sí misma .




MATERIAL GENÉTICO EN BACTERIAS.

El cromosoma bacteriano se compacta formando una estructura llamada NUCLEOIDE. Es un cromosoma circular y bicatenario formado por ADN, ARN y proteínas básicas. Se produce una interacción entre el ADN cargado positivamente y las proteínas cargadas negativamente.
Junto al cromosoma se pueden encontrar plásmidos.




MATERIAL GENÉTICO EN VIRUS

La mayoría de los virus, presenta un sólo cromosoma formado por ADN o ARN que puede ser unicatenario, bicatenario, lineal o circular.
Los fagos de bacterias están rodeados por una cubierta de proteínas e inyectan su cromosoma al interior de la bacteria. El cromosoma del virus puede seguir dos rutas dependiendo del tipo de fago que sea:
  • FAGO VIRULENTO: siempre sigue la ruta lítica.
  • FAGO TEMPERADO: pueden seguir la ruta lítica pero normalmente siguen la ruta lisogénica según la cual el fago está en la célula como un profago.

ciclo litico

  1. 1º Un fago se adhiere a la célula hospedadora e inyecta su ácido nucleico en la célula.
  2. 2º Con la "maquinaria" de la bacteria, el fago replica su material genético y sintetiza sus proteínas mientras que el cromosoma del huésped se degrada.
  3. 3º Los fagos se ensamblan en el interior de la célula huésped.
  4. 4º La bacteria se lisa y los fagos quedan libres.

ciclo lisogenico

  1. El fago se adhiere a la célula hospedadora e inyecta su material genético.
  2. La célula, tiene, en estos momentos, dos ADN circulares (uno de ellos del fago).
  3. El ADN del fago se integra en el cromosoma de la célula huésped.
  4. Se produce entonces la lisogenia: la bacteria es portadora del ADN del fago pero es inmune a su acción lítica aunque sí que pueden infectar a otras bacterias no resistentes a estos virus y provocar su lisis.


PLÁSMIDOS

Son elementos extracromosómicos, moléculas pequeñas de ADN que están libres en el citoplasma. Los plásmidos llevan información genética y se replican dando lugar a nuevos plásmidos que se incorporan a las células hijas en la división celular. Algunos de ellos pueden integrarse en el cromosoma. Los plásmidos pueden tener funciones diversas y algunos de ellos son plásmidos R, Col, y el factor F cuando está en estasdo citoplásmico.







OBJETIVOS

  • Comprender la forma en que está organizado el genoma de los organismos para entender su funcionamiento.

  • Relacionar los distintos grados de empaquetamiento con las distintas etapas del ciclo celular.

  • Discutir las distintas maneras en que el ADN se organiza en cromosomas, incluyendo virus, bacterias y eucariotas

lunes, 20 de febrero de 2012

resumen de clase del 14/02/2012

14 de febrero del 2012
Resumen de clase
Hay tres tipos de ADN que son los mas conocidos.



















El tipo A-ADN es menos hidratado.
El tipo B-ADN es más hidratado, es el más común en los seres vivos y fue la que descubrieron Watson y Crick.
El tipo Z-ADN es sintético
La característica acida del ADN se la da el grupo fosfato.




Propiedades del ARN
·         Esta constituida por una sola cadena de nucleótidos no es una hélice doble.
·         El ARN tiene azúcar ribosa en los nucleótidos en vez de desoxirribosa
·         Sus bases nitrogenadas son Adenina, Uracilo, Guanina y Citosina nunca Timina.
·         El ARN en virus tiene propia información y en seres vivos puede tener doble hélice.
·         No solo tiene información sino que ayuda a que la información se conviertan en proteínas,




Clases de ARN
Hay 2 clases:
1.- Informativos:  RNAm (mensajero)
RNAm: Esta tipo de RNA lleva la información de los genes a formar proteínas en los ribosomas





                                    RNAt (de transferencia)
                                   RNAr (ribosómico
2.- Funcionales       RNAsn (pequeño nuclear)
                                    RNAsc (pequeño citoplasmático)
Nunca se traducen a proteínas.
RNAt: transporta aminoácidos hasta RNAm durante el proceso de traducción (síntesis de proteínas)
RNAr: son los componentes de los ribosomas, (complejos moleculares que actúan coordinando el ensamblaje de proteínas.

resumen de clases del 10/02/2012

Unidad II

10 de febrero del 2012
2.1 Estructura química y física de los ácidos nucleicos: ARN y ADN
Estructura química
Compuesto solo de 4 moléculas básicas (A, T, C y G) llamadas bases nitrogenadas. Los  nucleótidos son los bloques que componen el ADN, cada nucleótido contiene una base nitrogenada diferente. Cada nucleótido esta compuesto por:
  • Azúcar, en concreto una pentosa: (ribosa para ARN) desoxirribosa para ADN)
  • Bases nitrogenadas: (A, T, C, G, para ADN) (A, U, C, G, para ARN)
  • Ácido fosfórico.




  • Diferencia química del ADN y ARN
    ·         El ADN tiene Timina y el ARN tiene Uracilo
    ·         El azúcar del ADN es desoxirribosa y del ARN es ribosa
    ·         En el carbono 2’ el ADN tiene un H y el ARN tiene un OH



    Estructura física



10 nucleótidos por vuelta aproximadamente
La distancia entre bases es de 0.34 nm



UNIDAD II  ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DEL MATERIAL GENETICO


SEP               SNEST               DGEST


INSTITUTO TECNOLOGICO DE CD ALTAMIRANO




CIUDAD ALTAMIRANO, GRO. MÉXICO. A 17 DE FEBRERO DEL 2012






INTRODUCCION

COMPOSICIÓN QUÍMICA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS


Miescher en 1871 aisló del núcleo de las células de pus una sustancia ácida rica en fósforo que llamó "nucleína". Un año más tarde, en 1872, aisló de la cabeza de los espermas del salmón un compuesto que denominó "protamina" y que resultó ser una sustancia ácida y otra básica. El nombre de ácido nucleico procede del de "nucleína" propuesto por Miescher.





Cuando se realiza la hidrólisis completa de los ácidos nucleicos, se obtienen tres tipos de componentes principales:
  • Azúcar, en concreto una pentosa.
  • Bases nitrogenadas: púricas y pirimidínicas.
  • Ácido fosfórico.
El azúcar, en el caso de los ácidos desoxirribonucleicos (ADN) es la 2-desoxi-D-ribosa y en el caso de los ácidos ribonucleicos (ARN) es la D-ribosa.




Las bases nitrogenadas que forman parte de los ácidos nucleicos son de dos tipos, púricas y pirimidínicas. Las bases púricas derivadas de la purina (fusión de un anillo pirimidínico y uno de imidazol) son la Adenina (6-aminopurina) y la Guanina (2-amino-6-hidroxipurina). Las bases pirimidínicas (derivadas de la pirimidina) son la Timina (2,6-dihidroxi-5-metilpirimidina o también llamada 5-metiluracilo), Citosina (2-hidroxi-6-aminopirimidina) y Uracilo (2,6-dihidroxipirimidina). Las bases nitrogenadas que forman normalmente parte del ADN son: Adenina (A), Guanina (G), Citosina  y Timina (T). Las bases nitrogenadas que forman parte de el ARN son: Adenina (A), Guanina (G), Citosina (C) y Uracilo (U). Por tanto, la Timina es específica del ADN y el Uracilo es específico del ARN.




Además de las bases nitrogenadas anteriormente descritas, se han encontrado otras bases nitrogenadas en algunos virus o formando parte de algunos tipos especiales de ARNs. Ejemplos de algunas de estas bases púricas poco corrientes son: Hipoxantina, Xantina, 2-metiladenina, 6-metil-aminopurina. Entre las bases pirimidínicas podríamos citar la 5-metilcitosina (propia del ADN) y la 5-hidroximetil citosina (HMC) que sustituye a la citosina en los fagos T-pares.
En los ARN transferentes (ARN-t) que intervienen en el proceso de traducción de proteínas se encuentran la Ribotimidina, Dihidrouridina, Seudouridina e Inosina (I).
La unión de la base nitrogenada a la pentosa recibe el nombre de nucleósido y se realiza a través del carbono 1’ de la pentosa y los nitrógenos de las posiciones 3 (pirimidinas) o 9 (purinas) de las bases nitrogenadas mediante un enlace de tipo N-glucosídico. La unión del nucleósido con el ácido fosfórico se realiza a través de un enlace de tipo éster entre el grupo OH del carbono 5’ de la pentosa y el ácido fosfórico, originando un nucleótido. Los nucleótidos son las unidades o monómeros utilizados para construir largas cadenas de polinucleótidos.
  • Nucleósido = Pentosa + Base nitrogenada.
  • Nucleótido = Pentosa + Base nitrogenada + Ácido fosfórico.
  • Polinucleóotido = Nucleótido + Nucleótido + Nucleótido + ....



Tanto los nucleótidos como los nucleósidos pueden contener como azúcar la D-ribosa (ribonucleótidos y  ribonucleósidos) o la pentosa 2-desoxi-D-ribosa (desoxirribonucleótidos y desoxirribonucleósidos).
Además, los nucleótidos pueden tener 1, 2 ó 3 grupos fosfato unidos al carbono 5’ de la pentosa, existiendo por tanto, nucleótidos 5’ monofosfato, nucleótidos 5’ difosfato y nucleótidos 5’ trifosfato. En algunos casos el ácido fosfórico se une a la pentosa por el carbono 3’, existiendo nucleótidos 3’ monofosfato, difosfato o trifosfato según el número de grupos fosfato que posea. Los nucleótidos se unen entre si para formar largas cadenas de polinuclóetidos, esta unión entre monómeros nucleótidos se realiza mediante enlaces fosfodiéster entre los carbonos de las posiciones 3’ de un nucleótido con la 5’ del siguiente




polinucleotido



OBJETIVOS:

·         Reafirmar y enriquecer el conocimiento de los ácidos nucleicos a nivel químico para su manipulación.

·         Observar y describir con detalle la estructura de las moléculas que participan en la transferencia de información.